Порт Піфагореї — порт античного поліса Піфагоріона на острові Самосі, на місці якого нині існує містечко Піфагорея. Один з найдавніших портів в Середземноморському регіоні.
Від давнього Піфагоріона вцілілі руїни давньогрецький театру, римських лазень, а також фрагменти укріплень і залишки палацу самоського тирана Полікрата. Над містом в VI столітті до нашої ери побудований Тунель Евпаліна — акведук, який постачав древнє місто водою гірських джерел.
1992 року порт Піфагореї разом із Герайоном на острові Самос внесений до переліку об'єктів Світової спадщини в Греції.