Ботанічний сад Південного федерального університету розташований в північно-західній частині Ростова-на-Дону, в долині річки Темерник. Є першим ботанічним садом на величезній території безлісної зони півдня Росії.
На території саду знаходиться мінеральне джерело, що носить ім'я Преподобного Серафима Саровського, який підноситься дирекцією саду як православна святиня.
Про необхідність створення в місті ботанічного саду вперше заговорили в 1915 році, після евакуації в Ростов-на-Дону Варшавського університету через небезпеку окупації польської столиці німецькими військами. Але тільки в 1927 році з ініціативи професорів В. Ф. Хмелевського і В. Н. Вершковського міська влада виділила під ботанічний сад 74,11 га. Ботанічний сад Північно-Кавказького університету був першим на величезній території безлісної зони півдня Росії. Головним його завданням вважалася акліматизація в степовому краї рослин з інших регіонів планети.
Ботанічний сад з'явився в 1927 році. На його місці ще в кінці 1920-х років в заплавній частині знаходилися городи і квітникарське господарство. Деревна рослинність майже відсутня. На високому правому березі річки Темернік вівся видобуток вапняку для міського будівництва. Безликий ландшафт зрідка порушувався заростями чагарнику в балках, верболозом біля річки і невеликою групою дерев у квітникарську господарства. Частина території була зайнята ріллею і мисливськими угіддями.
В основу планування саду була покладена карта Північного Кавказу. Передбачалося, що основні алеї та доріжки саду будуть відповідати контурам карти регіону та його залізничними лініями. У певних місцях доріжки за планом переривалися майданчиками і клумбами, що символізують міста і залізничні станції. За межами такої розбивки залишалися садиби будівель, оранжерея і парники, плодово-маточний сад, виноградник, дендрарій і ділянку грунтового квітництва. Згідно задумом авторів проекту, при розбивці території на окремі куртини потрібно було дотримати не тільки масштаб, але і відобразити відносний рельєф регіону і його рослинні особливості. Здійснити задумане виявилося неможливо. Представники субальпійських березняків, передгірних дібров і буково-ялицеві посадки, перенесені в нові умови, в перші ж роки майже всі загинули.
У закладці ботанічного саду взяли участь тисячі ростовчан. Всі роботи виконувалися вручну. Розпочаті в 1929 році, вони були в основному завершені в 1933 році. Вже в той час почали формуватися колекції декоративних, технічних та інших культур. До 1940 року колекційний фонд саду налічував понад тисячу найменувань рослин, в тому числі граб, платан, оксамитове дерево. Загальна площа склала 269,5 га, з яких 100 га займав дендрарій, 7 га оранжерея, 32 га розплідник.
Під час німецької окупації були зруйновані не лише оранжереї, службових будівель та споруд, але повністю загинули колекції оранжерейних і квітково-декоративних трав'янистих рослин. Істотно постраждали парк і дендрарій. Було знищено багато великих дерев таких порід, як дуб, граб, бук, сосна та інші. Загинуло близько 100 видів садових форм, що становило одну третину колекції, причому більшість найбільш рідкісних листопадних і вічнозелених рослин. У післявоєнний період всі будівлі і колекційний фонд ботанічного саду були повністю відновлені.
Зараз Ботанічний сад є держбюджетним навчально-науковим підрозділом Південного Федерального університету. За дорученням ректора він наділений повноваженнями юридичної особи, яка має окремий бюджетний баланс і друк.
Ботанічний сад Південного федерального університету — один з найбільших університетських садів Росії. Його площа перевищує 200 гектарів. У ньому ростуть більше 6500 видів дерев, чагарників і трав'янистих рослин. Майже 1600 видів і форм досягає колекція флори, зібрана в оранжереї тропічних і субтропічних культур. Створені відділи горіхоплідних, лікарських та інших рослин.
В оранжереях саду і у відкритому грунті росте понад 5000 видів дерев, чагарників і трав'янистих рослин, в тому числі в оранжереї тропічних і субтропічних рослин в колекції флори Африки, Південно-Східної Азії, Північної та Південної Америки, Австралії зібрано майже 1600 видів рослин. Сад включає в себе наступні колекції:
Особливо примітний 90-літній 25-метровий дуб звичайний, кущі самшиту, барбарису, тридцятирічне реліктове дерево гінкго, ялівець, обліпиха, а в оранжерейній колекції знаходяться агава, фікус, банан райський, фінікова пальма, бамбук.